Участники конференции

EUKARYOTIC RIBOSOMAL PROTEIN S3: A CONSTITUENT OF TRANSLATIONAL MACHINERY AND AN EXTRARIBOSOMAL PLAYER IN VARIOUS CELLULAR PROCESSES Graifer D., Malygin A., Zharkov D.O., Karpova G. Biochimie. 2014. Т. 99. № 1. С. 8-18. STRUCTURAL ASPECTS OF RIBOSOMAL LIGANDS INTERACTIONS PROVIDING THE WORK OF THE HUMAN TRANSLATIONAL MACHINERY Graifer D., Karpova G. В книге: Ribosomes: Molecular Structure, Role in Biological Functions and Implications for Genetic Diseases2013. С. 1-29. GENERAL APPROACH FOR INTRODUCTION OF VARIOUS CHEMICAL LABELS IN SPECIFIC RNA LOCATIONS BASED ON INSERTION OF AMINO LINKERS Graifer D., Karpova G. Molecules. 2013. Т. 18. № 12. С. 14455-14469. POSITIONING OF CCA-ARMS OF THE A- AND THE P-TRNAS TOWARDS THE 28S RRNA IN THE HUMAN RIBOSOME Bulygin K., Malygin A., G...raifer D., Karpova G., Hountondji C. Biochimie. 2013. Т. 95. № 2. С. 195-203. RIBOSOMAL PROTEIN S5E IS IMPLICATED IN TRANSLATION INITIATION THROUGH ITS INTERACTION WITH THE N-TERMINAL DOMAIN OF INITIATION FACTOR EIF2α Sharifulin D., Babaylova E., Kossinova O., Bartuli Y., Graifer D., Karpova G. Chembiochem : a European journal of chemical biology. 2013. Т. 14. № 16. С. 2136-2143. PHOTOACTIVATABLE RNA DERIVATIVES AS TOOLS FOR STUDYING THE STRUCTURAL AND FUNCTIONAL ORGANIZATION OF COMPLEX CELLULAR RIBONUCLEOPROTEIN MACHINERIES Graifer D., Karpova G. RSC Advances. 2013. Т. 3. № 9. С. 2858-2872. Vladimirov S.N., Graifer D.M., Karpova G.G. The proteins of donor tRNA-binding site of Escherichia coli ribosomes. // FEBS Lett. 1981. V. 135. P. 155-158. 2. Гимаутдинова О.И., Горшкова И.И., Карпова Г.Г., Кутявин И.В., Грайфер Д.М. Селективное алкилирование тРНКPhe по остатку G24. // Молекуляр. биология. 1984. Т. 18. С. 1419-1424. 3. Гимаутдинова О.И., Горн В.В., Горшкова И.И., Грайфер Д.М., Карпова Г.Г., Мундус Д.А., Теплова Н.М. Алкилирование тРНКPhe 4-(N-2-хлорэтил-N-метиламино)бензил-5'-фосфамидом d(ATTTTCA). // Биоорган. химия. 1986. Т. 12. С. 490-498. 4. Владимиров С.Н., Грайфер Д.М., Зенкова М.А., Казаков С.А., Карпова Г.Г., Кононова Р.Г. Применение сшивающих платиновых реагентов для изучения взаимодействия тРНК и мРНК с рибосомами. // Биоорган. химия. 1987. Т. 13. С. 1053-1058. 5. Булычев Н.В., Грайфер Д.М., Карпова Г.Г., Лебедев А.В. Препаративное выделение индивидуальной тРНКPhe высокоэффективной жидкостной обращенно-фазовой хроматографией. // Биоорган. химия. 1988. Т. 14. С. 27-30. 6. Tujebajeva R.M., Graifer D.M., Ajtkhozhina N.A., Karpova G.G. Alkaloid homoharringtonine inhibits polypeptide chain elongation on human ribosomes on the step of peptide bond formation. // FEBS Lett. 1989. V. 25. P. 254-256. 7. Graifer D.M., Babkina G.T., Matasova N.B., Vladimirov S.N., Karpova G.G., Vlassov V.V. Structural arrangement of tRNA binding site on Escherichia coli ribosomes, as revealed from data on affinity labelling with photoactivatable tRNA derivatives. // Biochim.Biophys.Acta. 1989. V. 1008. P. 146-156. 8. Бабкина Г.Т., Владимиров С.Н., Грайфер Д.М., Карпова Г.Г., Матасова Н.Б., Смоленская И.А. Выделение рибосом и субчастиц из плаценты человека и определение их функциональной активности. // Изв. СО АН СССР, сер.хим.наук. Вып. 2. 1989. С. 92-98. 9. Венкстерн Т.В., Грайфер Д.М., Карпова Г.Г., Морозов И.А. Исследование взаимодействия производного тРНКPhe, несущего арилазидогруппу на остатке G-24, с рибосомами Escherichia coli и с тРНК-(аденин-1)метилтрансферазой из Thermus Thermophilus. // Биополимеры и клетка. 1990. Т.6. С.59-65. 10. Graifer D.M., Zenkova M.A., Malygin A.A., Mamaev S.V., Mundus D.A., Karpova G.G. Identification of a site on 18S rRNA of human placenta ribosomes in the region of the mRNA binding centre. // J. Mol. Biol. 1990. V.214. P.121-128. 11. Graifer D.M., Nekhai S.Yu., Mundus D.A., Fedorova O.S., Karpova G.G. Interaction of human and Escherichia coli tRNAPhe with human 80S ribosomes in the presence of oligo- and polyuridylate template. // Biochim. Biophys. Acta. 1992. V.1171. P.56-64. 12. Tujebajeva R.M., Graifer D.M., Matasova N.B., Fedorova O.S., Odintsov V.B., Ajtkhozhina N.A., Karpova G.G. Selective inhibition of the polypeptide chain elongation in eukaryotic cells. // Biochim. Biophys. Acta. 1992. V.1129. P.177-182. 13. Malygin A.A., Graifer D.M., Bulygin K.N., Zenkova M.A., Yamkovoy V.I., Stahl J., Karpova G.G. Arrangement of mRNA at the decoding site of human ribosomes. 18S rRNA nucleotides and ribosomal proteins cross-linked to oligouridylate derivatives with alkylating groups at either the 3' or the 5'-termini // Eur.J.Biochem. 1994. V.226. P.715-723. 14. Graifer D.M., Juzumiene D.I., Wollenzien P., Karpova G.G. Cross-linking of mRNA analogues containing 4-thiouridine residues on the 3'- or 5'-side of the coding triplet to the mRNA binding center of the human ribosome. // Biochemistry. 1994. V.33. P.3878-3884. 15. Venyaminova A.G., Repkova M.N., Ivanova T.M., Dobrikov M.I., Bulygin K.N., Graifer D.M., Karpova G.G. and Zarytova V.F. New photoreactive mRNA analogs for the affinity labeling of ribosomes // Nucleotides & Nucleosides. 1995. V.14. P.1069-1072. 16. Мундус Д.А., Грайфер Д.М., Карпова Г.Г. Способ получения транспортной фенилаланиновой рибонуклеиновой кислоты (тРНКPhe) из препарата суммарной тРНК плаценты человека // Описание изобретения к патенту российской Федерации Nо. 2034292 (бюл. Nо. 12). 1995. 17. Nekhai S.A., Beletzkij V.E., Graifer D.M. Influence of systematic error on the shape of the Scatchard plot of tRNAPhe binding to eukaryotic ribosomes. // Biochem. J. 1997. V. 325. P. 401-404. 18. Graifer D.M., Malygin A.A., Matasova N.B., Mundus D.A., Zenkova M.A., Karpova G.G. Studying functional significance of the sequence 980-1061 in the central domain of human 18S rRNA using complementary DNA probes. // Biochim. Biophys. Acta. 1997. V.1350. P.335-344. 19. Bulygin K.N., Graifer D.M., Repkova M.N., Smolenskaya I.A., Veniyaminova A.G., Karpova G.G. Nucleotide G-1207 of 18S rRNA is an essential component of the human 80S ribosomal decoding center // RNA. 1997. V.3. P.1480-1485. 20. Demeshkina N., Repkova M., Ven’yaminova A., Graifer D., Karpova G. Nucleotides of 18S rRNA surrounding mRNA codons at the human ribosomal A, P and E sites, respectively: a cross-linking study with mRNA analogues carrying aryl azide group at either the uracil or the guanine residue. // RNA. 2000. V. 6. P. 1727-1736. 21. Грайфер Д.М., Карпова Г.Г., Кнорре Д.Г. Расположение матрицы на рибосоме человека по данным аффинной модификации реакционноспособными аналогами мРНК. Биохимия. 2001. Т.66. С. 725-744. 22. Demeshkina N., Laletina E., Meschaninova M., Ven’yaminova A., Graifer D., Karpova G. Positioning of mRNA codons with respect to 18S rRNA at the P and E sites of human ribosome. // Biochim. Biophys. Acta. 2003. V. 1627. P. 39-46. 23. Малыгин А.А., Грайфер Д.М., Лалетина Е.С., Шатский И.Н., Карпова Г.Г. Подход к выявлению функционально важных участков РНК, основанный на комплементарно-адресованной модификации. // Молекуляр. биология. 2003. Т. 37. С.1027-1034. 24. Graifer, D., Molotkov, M., Styazhkina, V., Demeshkina, N., Bulygin, K., Eremina, A., Ivanov, A., Laletina, E., Ven’yaminova, A., and Karpova, G. Variable and conserved elements of human ribosomes surrounding the mRNA at the decoding and upstream sites. // Nucleic Acids Res. 2004. V.32. P. 3282-3293. 25. Graifer D., Molotkov M., Eremina A., Ven’yaminova A., Repkova M. and Karpova G. The central part of the 5.8S rRNA is differently arranged in programmed and free human ribosomes. // Biochem J. 2005. V. 387. P.139-145. 26. Molotkov M., Graifer D., Demeshkina N., Repkova M., Ven’yaminova A., Karpova G. Arrangement of mRNA 3’ of the A site codon on the human 80S ribosome. // RNA Biology. 2005. V. 2. P. 63-69. 27. Laletina E., Graifer D., Malygin A., Ivanov A., Shatsky I., Karpova G. Proteins surrounding hairpin IIIe of the hepatitis C virus internal ribosome entry site on the human 40S ribosomal subunit. // Nucleic Acids Res. 2006. V.34. P.2027-2036. 28. Molotkov M.V., Graifer D.M., Popugaeva E.A., Bulygin K.N., Meschaninova M.I., Ven’yaminova A.G. and Karpova G.G. mRNA 3’ of the A site bound codon is located close to protein S3 on the human 80S ribosome. // RNA Biology. 2006. V. 3. P. 122-129. 29. Хайрулина Ю.С., Молотков М.В, Булыгин К.Н., Грайфер Д.М., Веньяминова А.Г., Карпова Г.Г. С-концевой фрагмент рибосомного белка S15 расположен в декодирующем центре рибосомы человека. // Молекуляр. биология. 2008. Т. 42. С. 306-313. 30. Babaylova E., Graifer D., Malygin A., Stahl J., Shatsky I., Karpova G. Positioning of subdomain IIId and apical loop of domain II of the hepatitis C IRES on the human 40S ribosome // Nucleic Acids Res. 2009. V. 37. P. 1141–1151.