|
Данные о статье:
|
|
Название статьи:
|
Квантово-химическое моделирование пептидных водородных связей в димере глицина
|
|
Все авторы публикации в порядке следования:
|
Лысенок А. А.,
Волкова Т. Г.
|
|
Аннотация:
|
Актуальной является задача изучения природы водородных связей в биологически активных и лекарственных веществах. Нестабильность водородной связи может существенным образом сказываться на состоянии фармацевтических препаратов, содержащих, например, аминокислоты при их длительном хранении, транспортировке или технологической обработке. Один из методов исследования природы и определения силы водородных связей – это квантово-химическое моделирование. Моделирование димера α–глицина проводилось в рамках теории самосогласованного реакционного поля методом DFT/B3LYP/6-31G (d, p) с полной оптимизацией геометрии без ограничений по симметрии. Теоретические спектры были получены на основе результатов расчета силового поля в гармоническом приближении. Визуализация результатов расчета проводилась в программе ChemCraft. В теоретическом КР-спектре к колебаниям водородной связи относятся только низкочастотные (2500 см-1) колебания водородных N–H…O связей двух молекул. Расчеты показывают особенность такой водородной связи – при сохранении водородной связи рвутся N–H и образуются O–H. В области 3200-3500 см-1 находятся четыре линии, из которых каждая соответствует валентным колебаниям свободных N-H связей аминогруппы одной молекулы. Расчет энергии взаимодействия в исследуемом ассоциате и ее декомпозиция были проведены по методу Морокумы (HF/6-31G (PC GAMESS). Установлено, что в энергию взаимодействия двух молекул глицина вносят значительные вклады все компоненты, за исключением энергии смешивания. Величина энергии взаимодействия с учетом ошибки суперпозиции базисного набора (BSSE) составляет -58.28 ккал/моль и соответствует двум сильным водородным связям и не противоречит данным о кристаллической структуре α-глицина.
|
|
ROI:
|
jbc-01/18-53-1-91
|
|
DOI:
|
10.37952/jbc-01/18-53-1-91
|
|
Ключевые слова:
|
сильная водородная связь, аминокислоты, квантово-химическое моделирование.
|
|
Общий форум статьи:
|
Смотреть форум
|
| Шапка статьи в pdf: |
Скачать [размер файла: 214кб.]
Дата:
18.08.2020 16:31:55
|
| Finish english abstract pdf: |
Скачать [размер файла: 254кб.]
Дата:
06.08.2020 14:41:44
|
|
Комментарий:
|
|
