Англо-русскоязычный научный химический журнал
"БУТЛЕРОВСКИЕ СООБЩЕНИЯ"
Русский | English

Главная/Авторизация |О журнале | Просмотр журнала/Поиск | Первичная регистрация | Интернет-конференции | Форумы

Сведения о статье:

Лысенок А. А.,  Волкова Т. Г.  Квантово-химическое моделирование пептидных водородных связей в димере глицина

Данные о статье:
Название статьи: Квантово-химическое моделирование пептидных водородных связей в димере глицина
Все авторы публикации в порядке следования: Лысенок А. А.,  Волкова Т. Г.
Аннотация: Актуальной является задача изучения природы водородных связей в биологически активных и лекарственных веществах. Нестабильность водородной связи может существенным образом сказываться на состоянии фармацевтических препаратов, содержащих, например, аминокислоты при их длительном хранении, транспортировке или технологической обработке. Один из методов исследования природы и определения силы водородных связей – это квантово-химическое моделирование. Моделирование димера α–глицина проводилось в рамках теории самосогласованного реакционного поля методом DFT/B3LYP/6-31G (d, p) с полной оптимизацией геометрии без ограничений по симметрии. Теоретические спектры были получены на основе результатов расчета силового поля в гармоническом приближении. Визуализация результатов расчета проводилась в программе ChemCraft. В теоретическом КР-спектре к колебаниям водородной связи относятся только низкочастотные (2500 см-1) колебания водородных N–H…O связей двух молекул. Расчеты показывают особенность такой водородной связи – при сохранении водородной связи рвутся N–H и образуются O–H. В области 3200-3500 см-1 находятся четыре линии, из которых каждая соответствует валентным колебаниям свободных N-H связей аминогруппы одной молекулы. Расчет энергии взаимодействия в исследуемом ассоциате и ее декомпозиция были проведены по методу Морокумы (HF/6-31G (PC GAMESS). Установлено, что в энергию взаимодействия двух молекул глицина вносят значительные вклады все компоненты, за исключением энергии смешивания. Величина энергии взаимодействия с учетом ошибки суперпозиции базисного набора (BSSE) составляет -58.28 ккал/моль и соответствует двум сильным водородным связям и не противоречит данным о кристаллической структуре α-глицина.
ROI: jbc-01/18-53-1-91
DOI: 10.37952/jbc-01/18-53-1-91
Ключевые слова: сильная водородная связь, аминокислоты, квантово-химическое моделирование.
Общий форум статьи: Смотреть форум
Шапка статьи в pdf: Скачать [размер файла: 214кб.]
 Дата: 18.08.2020 16:31:55
Finish english abstract pdf: Скачать [размер файла: 254кб.]
 Дата: 06.08.2020 14:41:44
Комментарий:




Главная/Авторизация |О журнале | Просмотр журнала/Поиск | Первичная регистрация | Интернет-конференции | Форумы

Все права пренадлежат © ООО "Инновационно-издательский дом "Бутлеровское наследие".